Seit einiger Zeit, ja? Was hammer denn für ne Monitor-Auflösung? Und hammer die eventuell vor einiger Zeit mal erhöht? 
Ältere Lichteffekte kann der FSX/P3D nicht skalieren; je höher die Auflösung, desto größer wirken sie.
Ansonsten fang mal bei der fx_2.bmp an, im Ordner \effects\texture. Viele Nav-Lichter für Addon- und AI-Flieger verwenden die. Die Default-Version im P3Dv4 ist immer noch die von 2006. Vielleicht hat die dir ein Addon überschrieben.
Falls ja, sei sicher, du willst das so. Denn die Addon-Hersteller wissen viel besser als du was du brauchst und fragen dich gar nicht erst 